微生物肥料的種類(lèi)很多，一般將微生物肥料制品分為兩大類(lèi)：一類(lèi)是狹義的微生物肥料，指通過(guò)微生物的生命活動(dòng)，增加了植物營(yíng)養元素的供應量，包括提高土壤和生產(chǎn)環(huán)境中植物營(yíng)養元素的供應總量，致使植物營(yíng)養狀況的改善，進(jìn)而產(chǎn)量增加，這一類(lèi)微生物肥料的代表品種是根瘤菌肥；另一類(lèi)是廣義的微生物肥料，指通過(guò)其中的微生物的生命活動(dòng)，不但能提高植物營(yíng)養元素的供應量，還能產(chǎn)生植物生長(cháng)激素，促進(jìn)植物對營(yíng)養元素的吸收利用或有拮抗某些病原微生物的致病作用，減輕農作物病蟲(chóng)害而促進(jìn)作物產(chǎn)量的增加。
按微生物種類(lèi)劃分
按微生物種類(lèi)可分為五大類(lèi)：①細菌類(lèi)肥料(如根瘤菌肥、固氮菌肥、解磷菌肥、解鉀菌肥、光合菌肥)；②放線(xiàn)菌類(lèi)肥料(如抗生菌肥)；③真菌類(lèi)肥料(菌根真菌肥：包括外生菌根菌劑和內生菌根菌劑)；④藻類(lèi)肥料(如固氮藍藻菌肥)；⑤復合型微生物肥料，即肥料由兩種以上微生物按一定比例組合形成。
按作用特性劃分
按作用特性可分為兩類(lèi)：
1、微生物接種劑
利用多孔的物質(zhì)作為吸附劑(如草炭)，吸附發(fā)酵液而制成菌劑。這種菌劑用于拌種或蘸根，一方面，肥料中的有益微生物通過(guò)其生命活動(dòng)增加植物營(yíng)養元素的供應，改善植物根際微生態(tài)環(huán)境；另一方面，有益微生物可通過(guò)非特異性拮抗作用，在作物根面、根際與病原微生物形成空間競爭，抑制或降低病蟲(chóng)害的發(fā)生頻率和危害程度，從而達到作物增產(chǎn)的目的。
2、復合微生物肥料
此類(lèi)肥料屬于復混肥的范疇其復混內容和形式比較多樣，包括多種微生物的組合、有益微生物與不同添加劑的組合等，其中添加劑包括有機物(畜禽糞便、革炭、褐煤等)、無(wú)機物(化肥、微量元素)等多種添加劑的復合制品。
按其功能和肥效劃分
按其功能和肥效可分為以下幾類(lèi)：①增加土壤氮素和作物氮素營(yíng)養的菌肥，如根瘤菌肥、固氮菌肥、固氮藍藻肥等；②分解土壤有機質(zhì)的菌肥，如有機磷細菌肥料、綜合性菌肥；③分解土壤難溶性礦物質(zhì)的菌肥，如磷細菌肥料、鉀細菌菌肥、菌根真菌肥料；④刺激植物生長(cháng)的菌肥，如促生菌肥；⑤增加作物根系抗逆能力的菌肥，如抗生菌肥料、抗逆菌類(lèi)肥料。從微生物肥料發(fā)展的趨勢來(lái)看，以復合微生物多功能、適應能力強的生物制劑配合有機肥料生產(chǎn)的有機復合肥，或開(kāi)發(fā)多功能光合菌肥的市場(chǎng)前景好。
按其成品劑型劃分
主要有液劑、粉劑和顆粒三種劑型。
1、液體類(lèi)
即將菌種投放到無(wú)菌罐中進(jìn)行工業(yè)深層發(fā)酵而成，其中活菌的含量將直接影響到肥料的應用效果。
2、粉劑類(lèi)
粉劑類(lèi)是由液體微生物肥料和草炭土等載體混合均勻而產(chǎn)生的，它具有運輸方便、含菌量高、增產(chǎn)效果明顯的特點(diǎn)。
3、顆粒類(lèi)
顆粒類(lèi)是液體微生物肥料經(jīng)過(guò)造粒設備進(jìn)行噴霧、造粒、低溫烘干而產(chǎn)生的，具有運輸方便、施用簡(jiǎn)便、保質(zhì)期長(cháng)的優(yōu)點(diǎn)。
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